FISH – широко распространенный цитогенетический метод, который применяют in situ для детекции и определения положения специфической последовательности ДНК на хромосомах. Для определения участков хромосом, с которыми связались флуоресцентные пробы, используют флуоресцентные микроскопы, высокочувствительные камеры и специальное ПО. Метод FISH часто применяют для поиска специфических участков ДНК для генетических консультаций, в медицине и идентификации видов.
FISH также применяют для детекции и определения расположения специфических мРНК в образце ткани. В последнем случае метод FISH позволяет установить пространственно-временные особенности экспрессии генов в клетках и тканях.